抛光机抛光操作的关键是设法获得更大的抛光速率，以便尽快去除抛光过程中产生的损伤层。同时，抛光损伤层一定不能影响观察到的组织，即不会造成假组织。
前者需要使用较粗糙的磨料来确保更高的抛光速率，以去除抛光损伤层，但抛光损伤层也更深。后者需要使用精细的材料来使抛光损伤层较浅，但抛光速率较低。解决这一矛盾的一个好方法是将抛光分为两个阶段。
粗抛光的目的是去除抛光的损伤层。在这一阶段，应该达到抛光速率。粗糙抛光造成的表面损伤是次要考虑因素，但也应尽可能小。二种是精细抛光（或抛光）。目的是消除由粗糙抛光引起的表面损伤，并将抛光损伤减少到少量。自动抛光机的操作相对简单，操作者只需要事先将待抛光的物体放在相应的夹具上即可。
将夹具固定在自动抛光机的工作台上。启动自动抛光机，自动抛光机在设定的时间内完成抛光工作，然后自动停止，只需从工作台上卸下物体即可。
在使用自动抛光机进行抛光之前，需要调整抛光头与工作表面之间的距离。为了达到良好的接触效果并抛出良好的效果。抛光过程中可以使用手动打蜡，以减少机器生产成本。
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